01.09.1968 года – ввод нового здания в эксплуатацию, начало образовательной деятельности учреждения. Муниципальное образовательное учреждение «Харовская средняя общеобразовательная школа №3» получила права юридического лица с самостоятельной финансово-хозяйственной деятельностью 20 марта 2000 года.
Учреждение Харовская средняя школа №3 начало свою деятельность 1 августа 1968 года.
На основании приказа отдела образования администрации Харовского муниципального района от 07.02.2000 года № 15 и решения комитета по управлению имуществом администрации Харовского муниципального района № 85 от 20.03.2000 года на базе Харовской средней школы №3 образовано муниципальное образовательное учреждение Харовская средняя общеобразовательная школа №3.
На основании приказа отдела образования администрации Харовского муниципального района от 23.01.2002 года № 12 и решения комитета по управлению имуществом администрации Харовского муниципального района от 25.03.2002 года № 214 муниципальное образовательное учреждение Харовская средняя общеобразовательная школа №3 переименовано в Муниципальное общеобразовательное учреждение Харовскую среднюю общеобразовательную школу №3.
На основании приказа отдела образования администрации Харовского муниципального района от 08.12.2005 года № 191 Муниципальное общеобразовательное учреждение Харовская средняя общеобразовательная школа №3 переименовано в Муниципальное образовательное учреждение «Харовская средняя общеобразовательная школа №3».
На основании приказа Управления образования Харовского муниципального района от 12.05.2010 г. № 91 «О реорганизации МОУ «Харовская средняя общеобразовательная школа № 3» путем присоединения к нему МОУ «Харовская средняя общеобразовательная школа №1» Учреждение реорганизовано в форме присоединения к нему Муниципального образовательного учреждения «Харовская средняя общеобразовательная школа №1».
В 2014 году школе присвоено имя Героя Советского Союза Василия Прокатова.